Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1182859	1182908	50	57 [0]	[0] 32	mipA	scaffolding protein for murein synthesizing machinery

ACCGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGA  >  minE/1182788‑1182858                                                                       | accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGCAAGATGCATTATCAGa  <  1:162342/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:560108/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:10190/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:420715/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:428200/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:428336/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:474379/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:480484/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:485489/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:491383/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:496685/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:499881/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:506441/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:539368/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:555797/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:397611/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:573997/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:580507/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:586857/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:599816/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:648255/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:648881/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:650918/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:65629/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:90706/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:93419/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:96299/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:97791/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:286432/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:103823/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:121407/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:123951/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:124884/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:128888/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:141475/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:208770/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:209811/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:250004/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:253392/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:253687/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:261049/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:377505/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:325413/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:329465/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:331320/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:370669/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:370773/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:372202/71‑1 (MQ=255) accGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGAACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:36973/71‑1 (MQ=255) accGTAATGAAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:339721/71‑1 (MQ=255) accGTAATGAAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:126801/71‑1 (MQ=255)  ccGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:404543/70‑1 (MQ=255)    gTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:430061/68‑1 (MQ=255)                          gCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:451033/46‑1 (MQ=255)                           cccTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:315032/45‑1 (MQ=255)                                 ttttATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:326181/39‑1 (MQ=255)                                    tATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGa  <  1:264717/36‑1 (MQ=255)                                                                       | ACCGTAATGCAAAACAGGGCGTGACGCCCTGTTTTTATGCACAAAATGCCCTGGAAAGATGCATTATCAGA  >  minE/1182788‑1182858

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑