Missing coverage evidence...
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ATTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGA  >  minE/1202637‑1202707                                                                       | aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:578202/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:114016/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:379516/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:39271/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:41849/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:429819/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:45770/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:482298/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:484468/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:374280/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:603061/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:634305/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:64373/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:649931/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:652099/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:84957/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:94991/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:373475/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:139609/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:145973/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:222002/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:222486/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:234198/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:236684/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:280153/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:290520/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:30336/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:30443/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:33468/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:355283/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:374062/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGGCGTGGa  <  1:300487/71‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGGTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:544451/71‑1 (MQ=255)           tGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:289438/61‑1 (MQ=255)           tGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:638114/61‑1 (MQ=255)                      acacTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGa  <  1:353111/50‑1 (MQ=255)                                                                       | ATTGGCCTGGTGCAAGACGGCACACTTTATTGCTCCAGCATTTTTGGTTATCGCAATGTGCCCGTCGTGGA  >  minE/1202637‑1202707

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑