Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1219673	1219739	67	13 [0]	[0] 56	yebR	conserved hypothetical protein

CAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATC  >  minE/1219603‑1219672                                                                      | cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTCAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:348001/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:106279/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:129807/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:133995/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:13665/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:166396/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:207746/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:231590/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:340598/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:346902/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:427244/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:476430/70‑1 (MQ=255) cAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATc  <  1:91406/70‑1 (MQ=255)                                                                      | CAAGCTGTGCCACAAGCTGACGTAAGCCTTGCTCGTCCTCGTCTGTAAAGCGACCGAAGACGGTACTATC  >  minE/1219603‑1219672

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑