Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1226439	1226515	77	20 [0]	[0] 37	pphA	serine/threonine‑specific protein phosphatase 1

ATCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATA  >  minE/1226384‑1226438                                                       | aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:150074/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:645790/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:642673/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:630828/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:609989/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:570392/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:516441/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:513017/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:495320/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:486338/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:45700/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:445765/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:420716/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:340329/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:312978/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:288393/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:285181/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:228877/55‑1 (MQ=255) aTCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:106141/55‑1 (MQ=255)        gCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATa  <  1:652589/48‑1 (MQ=255)                                                       | ATCGCGAGCGGCTCCACAAGACCTGATGCAAATCAACGTCCTTTTGCCATTCATA  >  minE/1226384‑1226438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑