Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	102242	102277	36	24 [0]	[0] 5	ppdD	predicted major pilin subunit

GTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGCC  >  minE/102171‑102241                                                                       | gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:418543/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:660581/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:595685/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:56669/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:560624/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:557238/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:541141/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:538703/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:511735/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:460723/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:439140/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:154593/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:37162/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:318084/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:266633/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:263977/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:252857/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:245859/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:220714/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:187542/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:172599/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:168887/71‑1 (MQ=255) gTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:158461/71‑1 (MQ=255)  tGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGcc  <  1:61102/70‑1 (MQ=255)                                                                       | GTGAGTGCGGCTTTGCGCAGGTAGTTTTGATAAGCGGGAATACCAATGGCGCTTAAAATGGCAATGATGCC  >  minE/102171‑102241

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑