Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1338254	1338309	56	20 [0]	[0] 14	[wcaE]–[wcaD]	[wcaE],[wcaD]

TGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCAA  >  minE/1338183‑1338253                                                                       | tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:532124/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:99117/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:80950/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:80209/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:649033/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:648291/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:605925/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:585366/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:544978/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:540475/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:299152/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:521399/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:486179/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:479971/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:475660/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:47060/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:46877/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:46810/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:323159/1‑71 (MQ=255) tGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCCTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCaa  >  1:407418/1‑71 (MQ=255)                                                                       | TGCGCCAGCGAGGCATGTGTTTTGACTATCCCTTCGAGGTTACGAAACGCGACAGTGATTATGCTAAGCAA  >  minE/1338183‑1338253

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑