Missing coverage evidence...
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AACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAG  >  minE/1388499‑1388569                                                                       | aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCATGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:277540/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:57976/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:402139/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:453632/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:461769/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:464684/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:481988/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:488188/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:534214/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:380945/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:590673/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:595097/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:630264/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:63936/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:644524/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:69668/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:81111/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:109190/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:117120/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:117526/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:122290/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:173895/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:18446/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:186218/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:209420/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:113383/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:282891/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:28650/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:315342/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:325125/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:350540/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:353617/71‑1 (MQ=255) aaCAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTCCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:515627/71‑1 (MQ=255)                               tcggtcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:393085/41‑1 (MQ=255)                                 ggtcAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAg  <  1:241578/39‑1 (MQ=255)                                                                       | AACAGTTGCACGCCAAGCTGCCCTTCCAGGTCGGTCAAGGCTGCGCTCACTGCTGATTGCGACAACGCCAG  >  minE/1388499‑1388569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑