Missing coverage evidence...
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GGATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGC  >  minE/1390509‑1390579                                                                       | ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCTGTGAAGGc  <  1:554472/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:587855/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:110976/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:511985/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:524729/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:552689/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:553322/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:579184/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:585566/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:508295/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:614823/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:634991/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:643325/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:645849/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:658428/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:81812/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:84064/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:481309/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:1125/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:16346/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:185715/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:211258/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:214051/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:256759/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:258398/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:292693/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:306784/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:382369/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:412572/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:4494/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:458897/71‑1 (MQ=255) ggATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:485954/71‑1 (MQ=255)  gATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:596973/70‑1 (MQ=255)  gATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:346593/70‑1 (MQ=255)  gATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:376728/70‑1 (MQ=255)                  gCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:624416/54‑1 (MQ=255)                          cACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGc  <  1:607520/46‑1 (MQ=255)                                                                       | GGATGCACCTTAACGATGCGAAAAGCACCTTTGGCAGCCGCGTTGACCGCCATCATAGCCTCGGTGAAGGC  >  minE/1390509‑1390579

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑