Missing coverage evidence...
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CCCTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTTAT  >  minE/1406023‑1406093                                                                       | cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:270818/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:520686/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:491524/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:539031/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:435232/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:434513/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:413158/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:541649/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:358248/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:350620/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:57909/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:28883/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:279958/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:249247/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:237278/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:608894/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:622323/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:627799/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:634473/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:165390/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:158832/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:158177/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:640809/71‑1 (MQ=255) cccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGGCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:232416/71‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:398373/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:520149/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:496135/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:476261/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:114041/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:322509/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:233920/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:211490/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:176432/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:155226/70‑1 (MQ=255)  ccTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGGGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:202383/70‑1 (MQ=255)   cTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTtat  <  1:546463/69‑1 (MQ=255)                                                                       | CCCTCGGATTGTGGAGCACGCTGATTATCTATCTGGTGTCGATTCCGTTAGGCATTCGCAAAGCTGTTTAT  >  minE/1406023‑1406093

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑