Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1537131	1537234	104	26 [0]	[0] 25	yfcS	predicted periplasmic pilus chaperone

ACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTT  >  minE/1537060‑1537130                                                                       | aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:39891/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:82729/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:635487/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:617246/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:613274/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:602693/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:601932/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:578621/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:561342/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:548747/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:531359/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:41046/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:108911/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:39139/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:384731/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:307127/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:235619/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:212382/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:182439/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:180036/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:1794/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:16805/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:140475/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:135253/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACtt  >  1:112905/1‑71 (MQ=255) aCGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACAGACtt  >  1:529954/1‑71 (MQ=255)                                                                       | ACGGCGTTGGGTTATTGACGGTAAATGCCTGACCGCTGCGGGTGAGCGTCACCTTGTGCTGCCACGGACTT  >  minE/1537060‑1537130

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑