Missing coverage evidence...
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GCGCCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGT  >  minE/1579281‑1579351                                                                       | gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACGAATTTCGCTCCCTGt  <  1:336610/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:537801/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:470523/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:137007/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:484421/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:505347/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:50967/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:514023/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:537315/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:476502/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:553638/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:564177/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:580841/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:584648/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:584981/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:650690/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:8861/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:446168/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:153063/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:169065/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:174252/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:205828/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:21371/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:229777/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:285684/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:286546/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:321481/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:335971/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:3544/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:407438/71‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:453501/71‑1 (MQ=255)  cgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:244006/70‑1 (MQ=255)  cgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:557438/70‑1 (MQ=255)  cgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:634785/70‑1 (MQ=255)  cgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:638678/70‑1 (MQ=255)  cgcCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:81573/70‑1 (MQ=255)   gcCAGCGCTGCGTCAATCAGCTGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:586330/69‑1 (MQ=255)                           cGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGt  <  1:156404/45‑1 (MQ=255)                                                                       | GCGCCAGCGCTGCGTCAATCAGCGGTCGGCTGCCTGACGCGTAATCCTGCAACACCAATTTCGCTCCCTGT  >  minE/1579281‑1579351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑