Missing coverage evidence...
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CAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTGCAG  >  minE/1634108‑1634177                                                                      | cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGCTCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:610549/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:399087/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:634909/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:631050/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:622287/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:603725/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:588962/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:568923/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:534333/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:510017/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:507730/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:106203/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:394013/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:382265/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:327666/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:271184/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:257465/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:171808/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:159768/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:154225/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:1341/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:113681/1‑70 (MQ=255) cAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGATTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTgcag  >  1:430695/1‑70 (MQ=255)                                                                      | CAGTGGCACCGGTCAGGCATCTGTCACTTTAAGTTTTAAAGCAGGCACCGATCCGGACGAAGCCGTGCAG  >  minE/1634108‑1634177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑