Missing coverage evidence...
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GGCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTAA  >  minE/1646428‑1646498                                                                       | ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:561273/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:385727/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:388299/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:39921/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:473731/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:482250/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:490222/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:496100/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:519327/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:530882/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:378276/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:564369/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:571495/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:586007/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:600063/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:614083/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:65903/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:68816/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:85867/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:96510/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:271079/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:135793/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:189602/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:207834/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:209818/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:214937/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:217296/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:240241/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:264363/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:290625/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:308878/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:317072/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:328251/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:336892/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:347845/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:348637/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTaa  >  1:367686/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCAATTaa  >  1:107440/1‑71 (MQ=255) ggCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCACCGCATTTaa  >  1:17727/1‑71 (MQ=255)                                                                       | GGCGCGTCCGCGTCCGCCAATGCCAGCATCTGTCTGGGTTCAGGTCGATGTGGCAGACTCCCCGCATTTAA  >  minE/1646428‑1646498

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑