Missing coverage evidence...
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TTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTA  >  minE/1749242‑1749303                                                              | tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:423259/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:84091/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:639334/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:637789/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:603588/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:526980/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:517920/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:50225/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:470166/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:467861/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:10871/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:364888/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:33758/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:336747/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:27813/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:265933/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:189346/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:187439/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:179042/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:163592/1‑62 (MQ=255) tttGATTTAAATCAATAAAAACCACACATAAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTa  >  1:37970/1‑62 (MQ=255) tctGATTAAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAAAGGATTTTATTGTTTTa  >  1:78032/3‑62 (MQ=255)                                                              | TTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCGCAAATGGATTTTATTGTTTTA  >  minE/1749242‑1749303

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑