Missing coverage evidence...
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CATCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGA  >  minE/1751170‑1751239                                                                      | catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:524095/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:105657/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:434347/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:439090/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:455757/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:470809/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:474846/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:488359/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:490563/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:491301/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:521801/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:401973/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:527620/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:550252/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:569056/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:579667/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:585392/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:637052/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:643286/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:80794/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:92234/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:97885/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:245323/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:114968/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:123519/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:15032/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:182791/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:190217/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:215164/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:223467/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:23706/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:40138/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:249949/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:255371/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:279220/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:287394/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:324837/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:351086/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:359836/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:377126/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:391809/70‑1 (MQ=255) catCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCATTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:45208/70‑1 (MQ=255)  atCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:559573/69‑1 (MQ=255)  atCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:208854/69‑1 (MQ=255)                gCCGCTTTTACCTTTCATATCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGa  <  1:188818/55‑1 (MQ=255)                                                                      | CATCACTTTGACCTTGCCGCTTTTACCTTTCATTTCATCGTTCATGCTTTTCTCCACCAGCGCTGCGCGA  >  minE/1751170‑1751239

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑