Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1777709	1777800	92	42 [0]	[0] 3	trmD	tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

CTTCGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAATTTT  >  minE/1777638‑1777708                                                                       | cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:59904/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:461520/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:487385/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:494079/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:498030/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:524538/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:528254/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:547106/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:549244/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:556704/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:570507/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:458816/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:600203/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:600422/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:611225/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:614009/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:641945/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:647196/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:647874/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:86157/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:88578/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:252442/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:117127/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:145170/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:14689/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:149485/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:160524/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:169162/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:169477/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:201459/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:235522/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:238454/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:27276/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:299999/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:341594/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:3916/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:408363/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:408612/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:423000/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:438604/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:445853/1‑71 (MQ=255) cttcGTCAATTCCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAAtttt  >  1:111082/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CTTCGTCAATTTCGGTTTGGATCACGCGCTCATCTATACCTTCGTAGCGACCGCACACCAGAATCAATTTT  >  minE/1777638‑1777708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑