Missing coverage evidence...
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AGGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGCC  >  minE/1782478‑1782548                                                                       | agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:465136/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:293383/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:310477/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:321263/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:360196/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:371879/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:37259/71‑1 (MQ=255) agGTCACGCCGCAAAACGACGGTTCGGTGATTATCGATGGCACCGCCAACGTGCGGGAAATCAACAAAGcc  <  1:394080/71‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑