Missing coverage evidence...
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TCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCAA  >  minE/1784823‑1784893                                                                       | tCACAACTGCGCGAACTGTGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:223155/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:353629/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:344086/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:362160/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:613757/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:377105/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:383658/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:406103/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:433223/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:433892/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:457517/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:459513/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:462307/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:586322/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:469830/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:583105/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:506692/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:521048/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:54737/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:227886/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:639965/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:123659/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:154892/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:15898/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:623032/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:192323/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:205557/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:213729/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:236168/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:239978/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:263245/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:268814/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:29278/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:305381/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:315706/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:328354/71‑1 (MQ=255) tCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCGCATCAATTACTCACCaa  <  1:523567/71‑1 (MQ=255)  cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:376725/70‑1 (MQ=255)  cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:503698/70‑1 (MQ=255)  cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:464141/70‑1 (MQ=255)  cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:116732/70‑1 (MQ=255)  cacaACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:118394/70‑1 (MQ=255)      aCTGCGCGAACTGGGGCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:526101/66‑1 (MQ=255)                       aGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCaa  <  1:162407/49‑1 (MQ=255)                                                                       | TCACAACTGCGCGAACTGGGTCAGTTGCTGATTCAGATCCATGGTCAGCACGCTCATCAATTACTCACCAA  >  minE/1784823‑1784893

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑