Missing coverage evidence...
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ATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGA  >  minE/1799064‑1799132                                                                     | aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:44882/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:85831/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:67349/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:631019/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:623244/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:616151/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:604349/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:577847/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:56610/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:556623/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:551677/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:531933/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:525458/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:514164/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:513226/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:47062/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:316457/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:121405/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:133390/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:162414/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:173098/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:175800/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:244014/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:272028/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:303531/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:100973/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:32196/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:32983/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:351340/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:362779/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:38240/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGa  >  1:447679/1‑69 (MQ=255) aTGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCAGTTCGa  >  1:489917/1‑69 (MQ=255)                                                                     | ATGTCGGACAGGCACCCTGTGCGGTGCCCGTGGTCGACGAGGACCAACAGTATGTCGGCATCATTTCGA  >  minE/1799064‑1799132

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑