Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1805260	1805347	88	79 [0]	[0] 5	emrA	multidrug efflux system

CAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAC  >  minE/1805189‑1805259                                                                       | cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:467090/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:514464/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:500016/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:491587/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:487422/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:484922/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:476686/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:470535/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:470313/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:469802/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:554663/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:464769/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:455874/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:452082/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:450223/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:449370/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:447141/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:441554/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:424438/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:417554/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:604890/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:94014/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:8626/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:75858/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:66812/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:646811/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:646138/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:641170/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:637881/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:605298/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:413054/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:603294/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:592843/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:592685/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:589628/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:581637/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:580528/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:566566/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:556977/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:556854/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:211865/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:252623/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:24717/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:239866/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:238172/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:23441/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:232206/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:216743/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:211871/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:405382/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:202059/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:18501/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:176424/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:155731/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:140524/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:126774/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:123843/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:116521/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:32021/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:100458/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:39292/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:386348/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:385046/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:384292/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:369793/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:367861/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:329441/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:263109/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:31725/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:306482/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:292055/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:285827/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:284880/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:281837/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:280696/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:27076/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCAATGAc  >  1:258003/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTAATATCAGTCCGATGAc  >  1:171489/1‑71 (MQ=255) cAACAGGCTGCAACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAc  >  1:166317/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CAACAGGCTGCCACCGAAGTACGTAACGCCTGGCTGGCGCTGGAGCGTACTCGTATTATCAGTCCGATGAC  >  minE/1805189‑1805259

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑