Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1828057	1828209	153	57 [0]	[0] 5	mutS	methyl‑directed mismatch repair protein

CAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTG  >  minE/1827986‑1828056                                                                       | cAATCATCGACACACCGCCGTTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:98651/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCTGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:300829/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGATCTg  <  1:125984/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:358440/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:361754/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:100164/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:364313/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:370292/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:382767/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:401976/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:403073/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:40793/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:421289/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:430582/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:439392/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:458516/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:467437/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:499460/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:501955/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:507425/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:535234/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:60390/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:605805/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:606505/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:653392/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:83850/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:346350/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:10171/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:112677/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:133352/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:139992/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:144862/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:156967/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:191623/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:197940/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:20529/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:219078/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:240150/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:31533/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:351401/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:32502/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:244496/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:292815/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:283033/71‑1 (MQ=255) cAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:24889/71‑1 (MQ=255)  aaTCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:402634/70‑1 (MQ=255)  aaTCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:233165/70‑1 (MQ=255)  aaTCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:319913/70‑1 (MQ=255)  aaTCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:426024/70‑1 (MQ=255)   atcatcGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:537779/69‑1 (MQ=255)   atcatcGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:362454/69‑1 (MQ=255)          acacacCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:135229/62‑1 (MQ=255)            acacCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTTGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:404471/60‑1 (MQ=255)               ccgccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:10223/57‑1 (MQ=255)                  ccgGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:279439/54‑1 (MQ=255)                    ggTGCTTGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTg  <  1:546236/52‑1 (MQ=255)                        cTGGTACGCTACGGTTGTGTTATCGCATCGGTCTATAACGAAGAGCTg  <  1:71298/48‑1 (MQ=255)                                                                       | CAATCATCGACACACCGCCGGTGCTGGTACGCGACGGTGGTGTTATCGCATCGGGCTATAACGAAGAGCTG  >  minE/1827986‑1828056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑