Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	161597	161706	110	46 [0]	[0] 9	cdaR	DNA‑binding transcriptional regulator

CCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAA  >  minE/161528‑161596                                                                     | ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:563481/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:103587/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:392390/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:426191/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:471513/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:4778/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:486284/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:491664/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:504014/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:528651/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:559302/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:376917/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:584983/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:591409/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:596322/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:614313/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:615751/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:619702/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:63201/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:651266/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:72399/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:80062/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:253832/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:107057/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:124494/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:15237/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:193038/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:207832/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:219512/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:223835/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:233510/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:237542/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:348486/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:261563/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:277291/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:2949/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:29806/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:309836/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:311311/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:316406/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:33966/69‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:344516/69‑1 (MQ=255)  cGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:271586/68‑1 (MQ=255)                  ttaaaTTGTCGTCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:648705/50‑1 (MQ=255)                      aTTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTaaa  <  1:2530/48‑1 (MQ=255)                              cGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCTTaaa  <  1:45045/40‑1 (MQ=255)                                                                     | CCGTTACGGCTGGAAGGTGAAATTGTCGGCGTAATTGGCCTGACAGGTGAACCAGAGAATCTGCGTAAA  >  minE/161528‑161596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑