Missing coverage evidence...
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GAAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGACTCACT  >  minE/1920827‑1920896                                                                      | gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:413803/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:73122/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:630171/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:628029/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:591380/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:538938/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:538141/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:515065/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:496620/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:460630/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:436147/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:110135/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:369033/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:347335/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:261246/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:237844/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:21753/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:195994/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:16822/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:148119/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:138187/1‑70 (MQ=255) gaAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGactcact  >  1:137969/1‑70 (MQ=255)                                                                      | GAAACTGCGCCACGATAACCGCTTTCATCCCCTTCGACCACAACGAAGTGTTAGTGTGCACTGACTCACT  >  minE/1920827‑1920896

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑