Missing coverage evidence...
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ACGACGCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACA  >  minE/1934374‑1934441                                                                    | acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:134993/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:96847/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:85218/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:7549/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:613921/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:582250/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:576690/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:507084/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:453959/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:399283/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:369678/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:367186/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:365556/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:356308/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:352370/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:348074/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:31923/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:319001/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:314672/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:283102/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:267039/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:261837/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:155420/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:228019/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:227242/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:217757/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:21260/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:211467/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:163983/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:162690/68‑1 (MQ=255) acgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGGCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:409039/68‑1 (MQ=255)  cgacgCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:11692/67‑1 (MQ=255)           ttCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:259955/58‑1 (MQ=255)               gTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACa  <  1:337467/54‑1 (MQ=255)                                                                    | ACGACGCGTTTTCAGTTCATTGTTAAGATCGACTACCGCGTCAGCGCCCTGTGCGTGTTGTTCAGACA  >  minE/1934374‑1934441

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑