Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1977076	1977285	210	45 [0]	[0] 5	[sprT]	[sprT]

GAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGTT  >  minE/1977006‑1977075                                                                      | gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:498050/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:379648/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:397615/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:408985/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:430113/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:444137/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:476472/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:486315/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:488693/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:490904/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:494229/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:356333/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:526906/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:56066/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:566830/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:572646/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:622749/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:647598/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:648566/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:652706/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:655854/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:78596/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:354189/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:119879/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:12216/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:146819/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:150568/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:176808/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:22814/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:23371/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:246655/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:247874/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:251584/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:2640/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:271033/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:310197/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:313177/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:318665/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:338362/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:344035/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:351397/70‑1 (MQ=255) gAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:117134/70‑1 (MQ=255)  caaCATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGGGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:325961/68‑1 (MQ=255)  aaaCATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:404105/69‑1 (MQ=255)      aTTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGtt  <  1:117767/65‑1 (MQ=255)                                                                      | GAAACATTTCGGCCGCGTAGCGCCACATGGCAAAGAGTGGAAGTGGATGATGGAAAACGTGCTGGGTGTT  >  minE/1977006‑1977075

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑