Missing coverage evidence...
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CGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTCC  >  minE/1994053‑1994122                                                                      | cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:506448/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:643881/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:626073/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:589311/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:57943/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:57285/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:559263/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:558562/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:55586/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:548068/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:544341/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:526570/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:152089/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:477563/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:430480/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:373040/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:351794/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:338067/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:331350/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:255215/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:205983/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:166105/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:164247/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCTAGAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:232348/70‑1 (MQ=255) cGCATCGGTTTCGCCATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:600700/70‑1 (MQ=255)  gCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTcc  <  1:199168/69‑1 (MQ=255)                                                                      | CGCATCGGTTTCGCTATAAACACCTTGCAGCTCCGGCGAAAATCCCGGCAACAAATTCACCCCTTCTTCC  >  minE/1994053‑1994122

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑