Missing coverage evidence...
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GCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGGTGT  >  minE/2038484‑2038554                                                                       | gCAACGGTGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:518569/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:116041/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:408826/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:426978/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:429610/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:448382/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:448582/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:467140/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:470817/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:514569/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:524803/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:576675/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:583838/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:636797/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:638982/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:92493/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:96962/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:302566/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:132867/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:206294/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:254364/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:267640/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:27444/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:283075/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:405927/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:307352/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:32188/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:328197/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:330412/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:334754/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:336609/71‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:338679/71‑1 (MQ=255)  cAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:304673/70‑1 (MQ=255)  cAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:7476/70‑1 (MQ=255)                           tCTGTGGGAGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGgtgt  <  1:563393/45‑1 (MQ=255)                                                                       | GCAACGGGGTCTAAACGCACCGCGATTCTGTGGGCGGGGATTTCTGGACTAGCAGAAATTCTTGGTGGTGT  >  minE/2038484‑2038554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑