Missing coverage evidence...
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CATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGA  >  minE/2136601‑2136671                                                                       | cATGCGCAGCAGACCACGACGTCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:93249/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:520041/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:99692/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:91615/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:69313/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:600708/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:578058/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:556855/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:550017/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:525373/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:102820/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:493634/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:484499/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:427486/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:405558/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:386976/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:248294/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:225363/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:220067/71‑1 (MQ=255) cATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGa  <  1:109585/71‑1 (MQ=255)                                                                       | CATGCGCAGCAGACCACGACGGCTGTGGTGATCTTTTTTGTGCTCTGCAAAGTGGCCCTGCAGGTGGTTGA  >  minE/2136601‑2136671

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑