Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2240577	2240631	55	33 [0]	[0] 24	zraS/zraP	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR/Zn‑binding periplasmic protein

CCATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGC  >  minE/2240506‑2240576                                                                       | ccgtCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:127013/68‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:621961/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:509386/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:514158/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:540965/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:551582/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:580324/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:589553/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:609407/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:615558/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:501029/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:623230/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:623237/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:79374/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:82837/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:86769/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:99390/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:508630/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:111106/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:478327/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:403037/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:364364/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:341107/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:300266/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:199330/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:162304/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:146393/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:121929/71‑1 (MQ=255) ccATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGT‑AAAATGACTCGc  <  1:254811/70‑1 (MQ=255)  cATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:493920/70‑1 (MQ=255)  cATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:366211/70‑1 (MQ=255)  cATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:158183/70‑1 (MQ=255)                        tGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGc  <  1:194166/48‑1 (MQ=255)                                                                       | CCATCTTTTATCAGCGCTTACCCTGCGCTGTAACACAAAGGCTTAAGTTTCAATGAGTAAAAATGACTCGC  >  minE/2240506‑2240576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑