Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2258201	2258299	99	33 [0]	[0] 58	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCG  >  minE/2258130‑2258200                                                                       | cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCTGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:246353/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:429185/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:95464/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:66581/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:633137/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:630286/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:621019/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:613536/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:586682/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:5530/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:519511/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:498849/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:492362/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:487821/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:459508/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:456940/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:223303/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:122538/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:152021/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:167930/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:172686/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:181637/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:218862/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:122532/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:232715/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:307152/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:320973/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:342472/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:371118/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:372564/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:38869/1‑71 (MQ=255) cGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTATCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:617919/1‑71 (MQ=255) cGTCTGGCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCg  >  1:85187/1‑71 (MQ=255)                                                                       | CGTCTGTCAGGCCCAGCTCCAGCCAGCGATCGCGCGGCAGTTTGTCGAGCTTCTCAGCTTCAACGCCACCG  >  minE/2258130‑2258200

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑