Missing coverage evidence...
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ACGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACG  >  minE/2283818‑2283888                                                                       | aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:528496/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:421053/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:433173/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:436162/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:448038/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:461854/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:490318/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:494315/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:49627/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:526307/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:149963/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:537860/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:539992/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:542704/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:55361/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:581189/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:601162/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:610720/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:628485/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:412237/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:103936/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:199496/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:203965/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:221407/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:234696/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:249142/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:253425/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:264281/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:288489/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:290152/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:354269/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:362645/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:393472/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:397759/71‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:413942/71‑1 (MQ=255)  cGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:227208/70‑1 (MQ=255)  cGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:215742/70‑1 (MQ=255)                              aTGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:98773/42‑1 (MQ=255)                                ggCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACg  <  1:96782/40‑1 (MQ=255)                                                                       | ACGTGGCAGGAATCTGCCGCACGCCGAAAATGGCGGTGTTCAGCCAATGCCACCAGGTACTCAAGATCACG  >  minE/2283818‑2283888

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑