Missing coverage evidence...
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GAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCG  >  minE/2288466‑2288536                                                                       | gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:447737/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:319468/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:116039/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:335525/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:342658/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:362304/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:392512/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:425169/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:425285/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:425993/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:442654/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:322133/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:472940/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:485049/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:497636/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:551120/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:563354/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:614863/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:620370/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:621999/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:642396/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:88344/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:310460/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:141036/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:149993/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:159583/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:173918/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:191354/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:19574/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:206947/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:221107/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:223596/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:22791/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:228187/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:240227/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:242317/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:252609/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:28077/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:283025/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:28667/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:294165/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:318387/71‑1 (MQ=255) gAATCATCAACTGGGTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAATCCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:649262/71‑1 (MQ=255)  aaTCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:521017/70‑1 (MQ=255)  aaTCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:378389/70‑1 (MQ=255)        caACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:121010/64‑1 (MQ=255)                 gAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCg  <  1:617314/55‑1 (MQ=255)                                                                       | GAATCATCAACTGGTTGAAGTGGTTGAGAAATTGCTCGGAGCAAAAACCGAAGTGGTGAACTACTGTACCG  >  minE/2288466‑2288536

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑