Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343405	2343524	120	22 [0]	[0] 33	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTG  >  minE/2343525‑2343595 |                                                                       cgcTGCTCAAGCGGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:226649/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:394514/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:3824/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:416694/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:442380/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:464406/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:474564/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:502551/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:510619/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:52504/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:582882/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:6179/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:619602/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:623296/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:66865/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:78834/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:85465/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:385557/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:105130/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:378028/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:322489/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:318984/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:304308/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:269046/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:251129/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:214604/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:196688/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:188330/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:186421/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:180139/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:119292/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:116001/71‑1 (MQ=255) cgcTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCATCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTg  <  1:2728/71‑1 (MQ=255) |                                                                       CGCTGCTCAAGCAGATTAAACAGCGCCATCCAATGCTTCCGGTCATCATTATGACCGCACATTCCGATCTG  >  minE/2343525‑2343595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑