Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2344642 2344708 67 11 [0] [0] 17 glnG fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

CTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTAAA  >  minE/2344709‑2344763
|                                                      
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:338548/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:85920/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:655680/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:60676/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:56005/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:54119/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:413178/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:402188/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:381871/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:14469/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:33316/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:29891/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:292014/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:261679/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:189122/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:169500/1‑55 (MQ=255)
cTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTaaa  >  1:153162/1‑55 (MQ=255)
|                                                      
CTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGTAAA  >  minE/2344709‑2344763

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: