Missing coverage evidence...
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ATGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGC  >  minE/2427040‑2427110 |                                                                       aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:600463/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:516504/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:52383/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:547253/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:550136/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:566886/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:58676/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:588353/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:589243/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:590383/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:500436/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:605862/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:610552/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:617372/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:621923/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:628838/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:639511/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:79397/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:98467/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:31214/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:110677/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:158699/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:174856/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:191963/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:242584/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:270104/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:282781/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:291765/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:105311/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:351683/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:384758/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:410689/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:423061/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:426240/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:450231/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:457741/71‑1 (MQ=255) aTGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGc  <  1:458902/71‑1 (MQ=255) |                                                                       ATGGAGCGAGCAGCCGATTCAACGTAGGTCATATCTGGCTCATGATCGCCCTTAAACGGCGTGGGTACAGC  >  minE/2427040‑2427110

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑