Missing coverage evidence...
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CGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCAA  >  minE/2513807‑2513875 |                                                                     cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:367909/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:9920/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:98750/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:914/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:85291/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:646586/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:566536/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:543221/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:541169/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:537531/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:510415/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:473597/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:471374/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:470890/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:382746/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:379157/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:108874/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:350518/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:328825/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:322410/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:301724/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:289535/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:244570/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:217294/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:21444/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:196646/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:185152/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:118052/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCGCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:209737/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGGCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAGTCGCCaa  <  1:345323/69‑1 (MQ=255) cGATGCGGCAGTGCTGGCGGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCaa  <  1:209040/69‑1 (MQ=255) |                                                                     CGATGCGGCAGTGCTGGCTGCGGGTCACTGTGGTTTTGGCCTCGGTGCAACGCCAACGGCAATCGCCAA  >  minE/2513807‑2513875

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑