Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2542505	2542540	36	38 [1]	[0] 59	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

CCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGTA  >  minE/2542541‑2542611 |                                                                       cccTCATTTGAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:67276/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:524341/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:450429/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:461075/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:461687/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:463542/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:46568/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:472421/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:476919/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:482212/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:488807/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:492762/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:495187/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:500040/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:504848/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:509764/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:435306/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:533790/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:534007/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:539741/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:549048/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:566871/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:571453/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:575728/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:607364/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:62289/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:656607/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:79874/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:87723/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:323505/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:117044/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:124806/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:144020/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:149160/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:156957/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:162930/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:172906/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:187840/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:209825/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:236567/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:265763/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:274960/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:290681/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:319426/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:100862/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:325551/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:334617/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:338882/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:341522/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:348040/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:362155/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:374040/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:38698/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:40667/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:414831/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:417208/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:42786/1‑71 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGt   >  1:422092/1‑70 (MQ=255) cccTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTC‑TACATTCTGGGTTTTGATCATTGGta  >  1:509123/1‑70 (MQ=255) |                                                                       CCCTCATTTAAGCATAGCTTAATATTATCAAGTTTAAAAGATTCTTACATTCTGGGTTTTGATCATTGGTA  >  minE/2542541‑2542611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑