Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2544481	2544545	65	44 [0]	[0] 28	[rfaL]–[rfaC]	[rfaL],[rfaC]

TGATAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCT  >  minE/2544546‑2544616 |                                                                       tgatAACTTTTCCAGAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:359138/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGATGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:131236/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATc   >  1:379631/1‑70 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:345804/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:660228/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:64577/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:6067/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:519564/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:466417/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:464501/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:439714/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:434294/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:416625/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:390034/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:352861/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:107219/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:345503/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:326394/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:293611/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:278618/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:267636/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:263102/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:221290/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:215849/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:168858/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:131884/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:120620/1‑71 (MQ=255) tgatAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCt  >  1:108139/1‑71 (MQ=255) |                                                                       TGATAACTTTTCCAAAACTGCTTGACTGTTGAGGTTAATTAAATTTTCTCTTGGAGCCCTACATACCATCT  >  minE/2544546‑2544616

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑