Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2562911	2562946	36	17 [0]	[0] 53	lldP	L‑lactate permease

AGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAC  >  minE/2562947‑2563017 |                                                                       aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTaa                                 >  1:405020/1‑40 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGa   >  1:155393/1‑70 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:591065/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:437212/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:44763/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:448931/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:451252/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:455227/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:461339/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:49095/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:495384/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:568006/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:573012/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:577480/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:585650/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:433877/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:595562/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:600375/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:612868/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:633715/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:648460/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:65253/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:655807/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:69469/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:86851/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:91056/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:98512/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:225713/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:128027/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:129181/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:131595/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:138079/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:140717/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:161238/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:161304/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:168211/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:181907/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:184395/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:190516/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:437055/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:228637/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:236044/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:257847/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:272792/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:273582/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:311947/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:376546/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:388898/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:396624/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:410903/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAc  >  1:105379/1‑71 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCACACAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGt              >  1:92778/1‑59 (MQ=255) aGAATGGCGGTGCCCGTGGCAGAGAACCAGTCaaa                                      >  1:245658/1‑35 (MQ=255) |                                                                       AGAATGGCGGTGCCGGTGGCAGAGAACCAGTCAAACTTAAACACGGCGGCATAGGCTGTAGCCTCGCTGAC  >  minE/2562947‑2563017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑