Missing coverage evidence...
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TTTATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATT  >  minE/2617166‑2617235 |                                                                      tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATTACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGa           >  1:18121/1‑61 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCTGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGa           >  1:207091/1‑61 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGa           >  1:70127/1‑61 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:568272/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:412774/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:436405/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:441653/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:452119/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:452817/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:452862/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:455830/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:471032/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:495931/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:5618/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:393637/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:575265/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:597960/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:611305/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:627637/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:84282/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:98446/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:30290/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:140633/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:172473/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:207524/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:212875/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:217543/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:231394/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:260670/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:263729/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:265212/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:400710/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:318597/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:323137/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:333827/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:353382/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:353643/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:378021/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:389250/1‑70 (MQ=255) tttATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCAtt  >  1:101346/1‑70 (MQ=255) |                                                                      TTTATCATCACAGGCCGCAAGCCCCATAACCAGCAGGCCAATTCCGACATATTTAACCAGATTGCGCATT  >  minE/2617166‑2617235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑