Missing coverage evidence...
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ATCATGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATCCC  >  minE/2849009‑2849079 |                                                                       atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGc                              >  1:376554/1‑43 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCctc                          >  1:96758/1‑47 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGGGATACAGCGGAATccc  >  1:436892/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAg           >  1:125544/1‑62 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:141205/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:114887/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:83457/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:76287/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:71695/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:614094/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:572614/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:555680/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:529711/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:529092/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:488012/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:452828/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:437917/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:43716/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:170871/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:402046/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:397206/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:378354/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:143657/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:35024/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:350236/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:335813/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:318248/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:286317/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:253521/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATccc  >  1:180523/1‑71 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATcc   >  1:269803/1‑70 (MQ=255) atcatGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATcc   >  1:171026/1‑70 (MQ=255) atcatGTTACACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATcc   >  1:581111/1‑70 (MQ=255) |                                                                       ATCATGTTCCACAGCATATGGTTGGTAATGTTGTCGCCGCTGCCCTCTTTGTTGAGATACAGCGGAATCCC  >  minE/2849009‑2849079

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑