Missing coverage evidence...
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CCGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTGG  >  minE/2914392‑2914461 |                                                                      ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:578836/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:467334/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:479815/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:480394/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:483833/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:485246/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:517690/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:537929/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:542403/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:578647/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:454962/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:602079/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:637788/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:646904/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:647709/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:76153/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:76165/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:91218/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:96437/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:373781/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:127861/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:131083/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:194144/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:226975/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:289369/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:310694/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:352607/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:356877/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:361132/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:117224/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:383721/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:403003/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:428215/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:429231/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:430605/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:439566/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:443125/70‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTgg  <  1:451941/70‑1 (MQ=255) |                                                                      CCGCAGCTGCCAGGGTCGCATGCAAATTATCAAATGCCAGTCTGACTTGTTGCTGAAAATCGGGTTCTGG  >  minE/2914392‑2914461

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑