Missing coverage evidence...
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GATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGCCAGT  >  minE/2938626‑2938696 |                                                                       gATGTGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:529690/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCATTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccag   >  1:538518/1‑70 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:487215/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:376464/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:386380/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:405838/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:411362/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:43664/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:443760/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:447283/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:456439/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:463389/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:480019/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:37602/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:517967/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:533806/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:579071/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:585483/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:591819/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:62437/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:90035/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:301640/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:16772/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:17236/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:20096/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:205813/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:210603/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:222802/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:232456/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:276312/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:282697/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:305720/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:306235/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:306317/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:318933/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:330493/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:334614/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:358700/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:370998/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:374603/1‑71 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccag   >  1:23431/1‑70 (MQ=255) gATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCACAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGccagt  >  1:103887/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GATGAGTATTGGTAATCTTTCAGAGTCCGGAAAAGTTCAGCCCCAGTCTGAACAGGCTTGCTGGCGCCAGT  >  minE/2938626‑2938696

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑