Missing coverage evidence...
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GGTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAGGG  >  minE/2940361‑2940431 |                                                                       ggTCCGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:613956/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTc                                      >  1:480844/1‑35 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:496659/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:390599/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:393727/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:403187/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:434529/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:452702/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:479298/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:483136/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:485975/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:110306/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:528071/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:569737/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:588209/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:610239/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:623442/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:642206/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:74980/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:379100/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:105524/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:118733/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:145854/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:152076/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:153086/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:18272/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:2044/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:209897/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:217767/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:272757/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:278010/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:295647/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:300723/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:361728/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:382052/1‑71 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAgg   >  1:244185/1‑70 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAgg   >  1:337381/1‑70 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAgg   >  1:351480/1‑70 (MQ=255) ggTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAgg   >  1:80417/1‑70 (MQ=255) ggTCAGAAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAggg  >  1:84644/1‑71 (MQ=255) |                                                                       GGTCAGCAGCGCGCGCCACGGCACGGGGATCACTCCCATATGGAGTGATAACAGCGCACAGCCCGCCAGGG  >  minE/2940361‑2940431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑