Missing coverage evidence...
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GCACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCA  >  minE/2961011‑2961081 |                                                                       gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:339251/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:81556/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:654787/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:641038/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:639698/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:58703/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:571591/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:547037/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:486211/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:478082/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:401406/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:389597/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:107794/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:333273/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:309603/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:276053/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:263260/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:226832/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:19138/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:166304/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:127965/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:126996/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:120815/71‑1 (MQ=255) gcACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCa  <  1:109474/71‑1 (MQ=255) |                                                                       GCACCTTTAACGCATCAGCCAACGGCTCAACGTCTTCCGGCGTGGCGCTCGCCCAGCTTTGCGCCTCGCCA  >  minE/2961011‑2961081

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑