Missing coverage evidence...
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TATGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCGAG  >  minE/2969582‑2969652 |                                                                       tatGGCCTTTTTCAACGTCTAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:467973/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:404839/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:77469/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:75436/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:655136/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:633291/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:61978/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:614625/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:576682/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:572447/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:408536/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:159835/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:37611/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:336425/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:329273/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:325648/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:317742/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:2492/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:23376/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:22242/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:199986/71‑1 (MQ=255) tatGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCgag  <  1:19890/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TATGGCCTTTTTCAACGTCGAAATGCAGTTCCACGCCGCCCCAGGTAAAGCGTTCATCCAGCAGATGCGAG  >  minE/2969582‑2969652

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑