Missing coverage evidence...
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CTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAG  >  minE/314278‑314347 |                                                                      cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGTAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:148643/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCa                          >  1:322601/1‑46 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:381557/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:643715/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:624887/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:581157/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:530045/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:506588/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:505618/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:456813/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:430134/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:42940/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:422389/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:4214/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:413281/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:412783/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:403594/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:375902/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:342860/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:272054/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:269285/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:264596/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:237619/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:237065/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:227888/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:227098/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:191573/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:166064/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:164419/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTAACATCCACCTCCCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:349476/1‑70 (MQ=255) cTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGCATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAag  >  1:518613/1‑70 (MQ=255) |                                                                      CTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAG  >  minE/314278‑314347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑