Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	323152	323502	351	5 [0]	[0] 58	[recR]	[recR]

CTCTCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCATT  >  minE/323503‑323572 |                                                                      ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCttt  <  1:616446/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:599126/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:132133/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:474271/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:494932/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:515842/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:52489/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:544217/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:546056/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:547901/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:550942/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:552047/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:561554/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:569630/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:582072/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:591316/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:472185/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:602969/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:60677/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:609955/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:614916/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:615721/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:619840/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:624346/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:630016/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:634607/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:655304/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:67998/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:97845/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:284630/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:146461/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:149520/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:152660/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:164851/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:180559/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:19227/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:200862/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:203765/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:217507/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:221129/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:230484/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:243235/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:247086/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:441796/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:330642/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:340364/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:341229/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:344650/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:348648/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:382097/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:382162/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:394970/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:404128/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:417042/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:419535/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:427008/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCatt  <  1:427550/70‑1 (MQ=255) ctctCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAAAGGCatt  <  1:85378/70‑1 (MQ=255) |                                                                      CTCTCGCTTGAAATTATTCTCCCTTGTCCCCATCTCTCCCACATCCTGTTTTTAACCTTAAAATGGCATT  >  minE/323503‑323572

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑