Missing coverage evidence...
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AATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCGC  >  minE/374377‑374446 |                                                                      aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTccc                          >  1:569345/1‑46 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTcc                           >  1:224287/1‑45 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTttcccttcc     >  1:571304/1‑67 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:504068/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:373562/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:392033/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:394244/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:403397/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:41394/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:438641/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:456741/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:496216/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:124966/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:517731/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:579145/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:600313/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:610551/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:66012/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:237926/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:120072/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:159842/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:176105/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:186833/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:203121/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:216199/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:229645/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:373285/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:252257/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:27061/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:288931/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:293196/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:296153/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:308064/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCgc  >  1:321918/1‑70 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCg   >  1:506621/1‑69 (MQ=255) aaTGCGCTCAATCAGTTAAGCAGTGACAATCTACTTCGGCGCTCCCTGAGc                     >  1:88219/1‑51 (MQ=255) |                                                                      AATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCGC  >  minE/374377‑374446

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑