Missing coverage evidence...
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TTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGC  >  minE/427846‑427916 |                                                                       ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:394932/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:94893/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:658274/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:656110/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:622223/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:580614/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:55591/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:400352/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:398765/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:398213/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:396773/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:140889/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:381174/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:375621/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:373718/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:355243/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:30575/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:277341/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:234866/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:20223/71‑1 (MQ=255) ttGGTGAATACACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGc  <  1:391623/71‑1 (MQ=255) |                                                                       TTGGTGAATTCACCAACGCGGCGGGTACGGTTTTCCACGGTGACATTAACCGCTTCTATGCCGGTGACGGC  >  minE/427846‑427916

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑